Create gromacs_2022.2 authored by Bruno da Silva Castilho's avatar Bruno da Silva Castilho
#### Links
- [Repositório](https://codigos.ufsc.br/bioinfo/gromacs-2022.2)
- [Modelo de teste](http://www.mdtutorials.com/gmx/membrane_protein/Files/KALP-15_princ.pdb)
#### Instalação
- Faça o download da imagem em seu computador:
```
registry.codigos.ufsc.br/bioinfo/gromacs-2022.2:latest
```
#### Utilização
- Para utilizar o serviço, deve ser iniciado o container, compartilhando o diretório dos modelos com a pasta `/input` do mesmo e executado o comando para inicialização do processamento:
```
docker run -v "/home/modelos:/input" --rm registry.codigos.ufsc.br/bioinfo/gromacs-2022.2:latest bash -c "gmx pdb2gmx -f KALP-15_princ.pdb -o KALP-15_processed.gro -ignh -ter -water spc"
```
(Nota: Os modelos estavam no diretório `/home/modelos` do host e foi executado o modelo `projeto1`.)